魏征曾经向李二推荐过侯君集，还说侯君集有宰相之才。

换言之，魏征根本就是与侯君集站在同一条道上的人。

他当然不会弹劾侯君集，正想着办法帮侯君集免去牢狱之灾。

李二本想保存侯君集，毕竟侯君集支持发动玄武门事变，并且参与率军控制唐高祖和朝臣，其功劳很大。此后，他又立过不少军功。

可是，侯君集如今所犯之事，惹了众怒，李二唯有将其下狱审判。

就在这个时候，银青光禄大夫岑文本站出来替侯君集求情。

岑文本给李二呈上一封奏疏，长篇大论的引经据典，为侯君集开脱罪名。

岑文本奏疏中列举了汉武帝、汉元帝、晋武帝、隋文帝等君主的例子，劝说侯君集功大于过，不应下狱，反而要受到封赏才对。

李二本来就想过保存侯君集，看完岑文本奏疏，更是找到了替其开脱的理由，便释放了侯君集。

最后，侯君集功过相抵，既没有受到封赏，也没有受到惩罚。

不过，这件事之后，侯君集把李在古当成了眼中钉肉中刺。

侯君集平时与岑文本并不是很熟，只是点头之交，他不明白岑文本为什么要帮他。

但不管怎样，岑文本帮了他，他获得释放之后，立即登门拜访岑文本，以示感谢。

岑文本对侯君集说，他只是做了认为对的事，并不是因为对方是何人。

侯君集辞别岑文本，回到家中。

他总觉得岑文本帮自己，目的不纯。

不管怎么说，岑文本是帮了自己，这个恩情，日后有机会一定会报答。

侯君集虽然没有受到处罚，但他自以为在西域立了功，却因贪污而被下狱囚禁，心中怏怏不乐，怨恨朝廷对他不公。

与此同时，李二授封归唐后的麴智盛为左武卫将军、封金城郡公。授其弟麹智湛为右武卫中郎将、天水郡公。

在唐军平定高昌后，李二与部分大臣考虑到高昌等西边地区的重要性，经过深思熟虑，多次商议，李二决定按照大唐的制度在高昌地区实行州县制，以高昌为西州，并在交河城设置了安西都护府。

同时，为了便于大唐朝廷能够在西州地区征集军队，又设置了折冲府。

后来，这些折冲府的府兵对打击西突厥、抵御吐蕃、维护丝绸之路等，发挥了重要的作用。

李二考虑到李在古多次参与西边地区的军事，又在沙州做过刺史，对西边地区熟悉，因此任命李在古为安西都护府首任都护！

李在古出任安西都护府都护后，按照大唐在中原的制度，对高昌实施均田制、租庸调制、驿站制度，以及兴修水利及设置官市，使得大唐对高昌的统治很快便稳定下来。

李在古经营安西都护府的同时，向李二送去一份奏疏。

奏疏的内容是提醒李二，要警惕西突厥，特别是要警惕西突厥的乙毗咄陆可汗欲谷设。

欲谷设觊觎大唐，之前高昌与大唐作对，也是此人从中作梗。

李在古除了提醒李二要警惕欲谷设之外，还就应对西突厥的方法上提了建议。

李在古认为，西突厥所管治的地方表面上看起来很大、很广，但实际上西突厥内部四分五裂。

欲谷设并没有完全统治整个西突厥，有不少部落首领不服他的统治。

其中，以乙毗沙钵罗叶护可汗为首弩失毕部更是一直与欲谷设作对，多次兵戈相见。