当时的先行者认为本尊宣教士已经死亡，因此新生之星得到了新星宣教士的头衔，并带领先行者对抗洪魔。在一路追踪偏见之僧的轨迹后，新星宣教士夺回了被它控制的环带，并击败了偏见之僧和原基。

但此时银河系三分之二的区域被洪魔蹂躏，新星宣教士终于相信光环才是解决洪魔的唯一手段。在战争期间，本尊宣教士成功从洪魔控制区返回，而在此之前他被洪魔复合意识尸脑兽捕获。

这些遭遇让本尊宣教士变得疯狂偏激，他利用重组机将自己的普罗米修斯士兵转换为了机械部队（在四代终端机中，普罗米修斯们是自愿的），这些机械战士能够高效清除洪魔并且能够不被感染。

尽管这一举措十分成功，但机械部队数量稀少，还不足以彻底击败洪魔，因此本尊宣教士将目光转向了艾德特瑞尼和他曾经的敌人——人类。本尊宣教士重组人类的残忍行为震惊了智库长，她被迫对抗宣教士，最后把他封入了安魂星的冥冢中。

洪魔继续在银河系肆虐，而偏见之僧又一次重归洪魔的怀抱，这一次则是执行尸脑兽的意志。最后一部分先行者退守大方舟，在那里有着欧米茄光环和先行者军队驻守，并且有着偏将近逼坐镇。大架构师则要求亲自控制欧米茄光环与洪魔作战。

在大方舟附近的欧米伽光环上参与了由新星宣教士、败战之苦和考官等人进行的作战准备。他们准备启动这座光环向卡梭那之路发射，扫除卫星系中的先驱者结构和潜在的洪魔威胁，打开一条走廊，试图突围出包围方舟的星路。

没有经过任何仪式，费伯便直接将小方舟的秘密坐标交给了新星宣教士，而后者负责部署并激活最后的光环阵列。费伯特地来到欧米伽光环会见新星宣教士，似乎除了亲眼观看光环开火外别无所求。

随后，大架构师亲自启动了光环超级武器，并宣布自己将不会试图逃跑，而是和自己的方舟同沉。在生命的最后一刻，他罕见地对自己犯下的诸多罪行进行了忏悔。

”纵观我的一生，我不断地为我自己和我的阶级追寻利益。现在，我想我终于明白了忤逆衣钵的罪行。在此之后，我也无需寻求平衡了。我会在这里等待我的救赎。“

一场惨烈的大战过后，先行者最后的人口中心和欧米茄光环覆灭在了洪魔铁蹄之下。

只有极少数先行者幸存，新星宣教士撤退到了幸存的小方舟，在这里有着第二套也是最后一套光环阵列。竞技级AI进攻偏执也成功幸存并带着所剩不多的先行者舰队来到此处作最后抵抗。

新星宣教士将环带送到预设地点，随后启动了光环阵列，光环的毁灭冲击覆盖银河系，清除了所有有感知生命体并消灭了洪魔。而智库长则是死在了艾德特瑞尼。

光环启动后，偏见之僧想要尝试抵抗另一个竞技级AI进攻偏执的攻势，但已无力回天，他再一次被先行者捕获，这一次他被囚禁在小方舟深处。

光环的效果极佳，清除银河系一切有感知生命。在接下来的日子里，新星宣教士带领着幸存的先行者开始了银河系的播种任务。而幸存的先行者们也在新星宣教士完成修复智域的任务后离开了银河系。