明崇祯十七年、清顺治元年、顺永昌元年、西历1644年四月二十九日夜，李自成全军撤出北京，第二天一早，相关消息就被人报告给了多尔衮，多尔衮便于当日上午下令诸王、贝勒、贝子、公等率八旗兵追赶，吴三桂此时也接到了命令，同在追击行列。

顺军离开北京后，李自成以左光先、谷大成两部率二万骑兵断后，又使出当年对付明军的那套丢弃辎重的战术来减缓敌军的阻击速度，从而暂时摆脱了后方的追兵，得以一路安全西行。

当年五月初一，李自成率部退到涿州，但城内原明军官绅冯铨已经得知顺军在山海关战败的消息，因此率城内军民坚决拒绝李自成部入城；顺军当然发起了进攻，但由于担心后方追兵，所以，初战未能得手，便放弃了继续进攻，然后向保定逃去。

五月初二，也就是朱由崧登基称帝以及多尔衮进入北京的当日，清军前锋在保定附近追上了顺军，双方大战一场，顺军再次战败，不得已，继续向南逃亡。

五月三日，顺军后卫与清军前锋在定州北清水河岸展开交战，此战中谷大成牺牲、左光先负伤，但总算迫使清军停下了追击脚步，李自成部这才得以安全的退往山西。

虽然接下来清军为了稳固京畿周边形势，并未立刻南下西进，但此时，大顺制将军白邦政、巡漕户政府从事方允昌对陈州、归德等地的进攻，被许定国、刘洪起等明军将帅所粉碎；大顺德州权防御使阎杰和德州牧吴征文等被诸生、明大学士谢升之弟谢陛所率领的地方民团杀死；大顺沧州守将被原明尚宝司卿程正揆率部推翻；原明职方司主事凌駉于临清起事，俘虏了大顺防御使王皇极；原明宣化镇总兵姜瓖杀死了大顺大同守将张天琳。

因此，一时间，大顺政权在直隶、山东、河南等地的统治已经处在了土崩瓦解的状态下。

所以，为了确保尚余统治区的稳定，李自成便借清军主力回缩至京畿周边的时间机会，在力所能及的范围内对反叛者进行了军事镇压----顺军在榆次、太谷、定襄等地进行了三次较大规模的屠杀，造成了总计万人的伤亡，朱由崧刚刚册封的淑妃梁氏的母族就在顺军屠戮太谷时被杀了干净----此外，顺军还大量迁徙缙绅富户，将他们从山西、河南前线，迁往了陕西西安，同时还集中兵力“分守山西诸隘”。

顺军开始收缩力量，以应对比起明军来更可怕的清军了，但南明这边却一时没有抓住反击的机会：

西线这边，朱由崧册封左良玉为武提督，命其以襄樊为基地，向北收复南阳，向西收复荆州、郧阳的诏书，差一点被左良玉给撕了，只是迫于孙传庭、路振飞率部西进的消息，左良玉才捏着鼻子承认朱由崧成为大明皇帝的现实，不过，左良玉承认了朱由崧的帝位，却也始终没有出兵北上，就此丢失了夺取襄樊的机会。

东线这边，史可法于五月初五才离京北上，行动迟缓的他于五月十五日才抵达徐州，然后，史可法在徐州以召集睢州许定国、陈州刘洪起、鹿邑刘洪礼、太康周道玄、单县徐良臣等部会攻济宁、复夺兖州的名义整整滞留了十天，这才在朱由崧派出的内监的催促下，率部北上夺取了顺军董学礼、傅龙两部一早放弃的济宁和兖州；但在夺取济宁和兖州之后，史可法除了飞檄山东、南直隶外，就再也不肯前进一步了。