武承嗣在为武则天称帝大造舆论的同时，极力向武则天建议“去唐家子孙，诛大臣不附者”。

光宅元年九月，徐敬业，骆宾王等，为反武则天掌权，以“匡复庐陵王为辞”，在扬州起兵。

武承嗣和堂弟武三思以唐高祖李渊的儿子韩王李元嘉、鲁王李灵夔等展开反击，“属尊位重，屡劝太后固事诛之”。

垂拱四年八月，唐太宗儿子豫州刺史越王李贞、李贞子博州刺史琅邪王李冲起兵反对武氏掌权，很快兵败被杀。武则天以李元嘉、李灵夔等一批李唐诸王，与越王李贞父子通谋，全部杀掉。

天授元年七月，武承嗣唆使酷吏周兴，罗织唐高宗李治子隋州刺史泽王李上金、舒州刺史许王李素节谋反罪名。

在押解途中，武承嗣派人缢杀李素节，李上金自杀，并尽杀其诸手及支党。

八月，又杀南安王李颖等李唐宗室十二人。唐朝宗室几乎被屠戮殆尽。

与此同时，武承嗣还劝武则天杀掉李孝逸、韦方质等许多声望甚高，但不屈服于武氏的文武大臣。武承嗣大杀李唐宗室和不附己的文武大臣，无疑为武则天称帝扫清了道路。

武则天称帝后，以其子李旦为太子。武承嗣就瞄准了太子这个位置。他懂得只有先当上太子，将来才能当上皇帝。

他不断派人向武则天游说、乞请，同时极力讨好武则天和其宠臣，谋求争得他们的支持和赞同。

天授二年九月，武承嗣令凤阁舍人张嘉福，唆使洛阳人王庆之等数百人上表，请立武承嗣为太子。