沐琮致力于屯田及水利建设，又曾因广西土官暴虐，奏请废黜当地土官，改设流官，这些举措使百姓大感便利。寻甸酋长杀死兄长的儿子，请求袭封职位，沐琮发兵征讨，将其诛杀，在镇期间，他又依次平定马龙、丽江、剑川、顺宁、罗雄诸地部族起事，擒获桥甸、南窝的叛乱者，为稳定云南局势作出了贡献。

沐琮镇守云南期间，尊崇学官，他以身作则，在每月朔、望之日，都要拜谒孔子庙，并且让诸生执经讲解。云南有举乡试的生员，沐琮一定设宴优奖，以养成重学风气，在提高自身文化素养的同时，促进了云南文教事业的发展。

沐琮通经义，能词章，于“武经阴符、奇门诸书、阴阳卜筮、星命之术”多有涉猎。又擅写草书，通晓乐府诗歌，其诗瑰丽可观。

梁羽生武侠小说《散花女侠》、《联剑风云录》中重要人物，也就是这位明朝世袭的云南沐国公沐琮，引入到了小说中，儿子：沐磷，女儿：沐燕，女婿：铁镜心。