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大明的六部九卿由来已久，西周时期设六部，分别为司徒、司马、司空、司寇、大行人、宗伯，隋唐后演变为吏、户、礼、兵、刑、工六部。

九卿的发展又不相同，秦汉时期是指奉常、郎中令、卫尉、太仆、大理寺卿、典客、宗正、治粟内史和少府这九个部门，后逐渐缩减，至明代只剩下大理寺、太常寺、光禄寺、太仆寺、鸿胪寺。

再加上都察院、通政使司，基本上就是大明全部的权力机构。

至于翰林院，则是大明的文史研究加人才储备机构，每一届科举产生的新科进士大概有三百名，通常来说，前一百名会留在翰林院，每日抄抄写写，积累经验，等待机会。

随着科学院的兴起，翰林院地位日渐式微，因为这些翰林老爷们只读经史，不涉及其他学科，现如今新政已经全面铺开，传统的读书人已经愈发感觉到吃力。

朱祁镇大笔一挥，直接将翰林院改为文史研究院。

然后写上内阁两个大字，在后面打了个叉。

当初朱元章废中书省，咱朱家子孙不能忘本，干就完了！

于谦继续任兵部尚书，曹鼐任吏部尚书，邝埜已经交了三份辞呈，看样子是真的干不动了，便由张益来接任任礼部尚书。

彭清这边需要新设海事总督府，与六部平级，并在海外诸国设领事馆，长期派驻官员。

科学院的变化最大，需要将与其他六部相关的学科独立出来，分设在六部名下，比如户部的农学研究所，算学研究所；工部的土木研究所，水利研究所；兵部的武器装备研究所等等。

除此之外，科学院还需要负责教学和科举，并将考题分为文史、理学、工学、武科等不同类别，诸学子可根据自己的特长报名，参加相对应的考试。

三日之后，贝琳拿着一份厚厚的章程进宫。

朱祁镇细细翻看，感觉很满意。

科学院做事就是靠谱，几乎将方方面面都考虑到了，所有流程非常完善。

“不错，就按这个来吧！”

贝琳神色恭敬，问道：“皇上，真的不需要送内阁票拟吗？”

“不需要，你直接拟定圣旨，拿去司礼监加印。”

“臣斗胆谏言，这样似乎……不是很好……”

朱祁镇双眼一瞪，不满道：“朕让你去，你就去，无须多言！”

贝琳咽了口唾沫，又说道：“这次恩科的出题人……”

“这还用说，当然是从科学院出！你现在就回去挑人，成立恩科命题小组，无论是谁，一旦入选，需暂时与外界隔离，并由锦衣卫看护，每日三餐朕派人去送，直至开考之日！”

“在此之前，若是有人擅自离开，按考题泄密论处！”

贝琳疑惑道：“全部从科学院选吗？”

“你是主考官，你来定！”

“臣建议……文史类的考官，还是从翰林院选？”

“朕都说了，你来决定，报朕批阅即可！”

“是，臣这就去安排。”

贝琳感觉压力很大，前所未有的大。

科学院刚成立的时候，他力排众议，特立独行，敢与所有人对喷，那时候反倒没什么压力。

现在则不同，皇上通过不断变革，把科学院捧到了一个前所未有的高度。

科举是朝廷的根基，谁来主持科举，谁就是朝中权力最大的那个人。

贝琳思来想去，还是说道：“皇上，真的不需要和内阁商议？”

朱祁镇澹澹道：“朕已经将内阁撤了，明日便昭告天下！”

“啊？真的撤了？”

“朕说撤了就是撤了，还能跟你开玩笑不成？”

“那恩师……”

“成立海事总督府，由彭卿家任总督大臣，主管海贸、海运、外交及海外诸国的领事馆。”

贝琳努力琢磨了半晌着，然后说道：“臣明白了！”

皇上是铁了心要搞大事情，这一次谁也拦不住。

目前来看，每项改革都是好的，唯一的问题就是步子太大了，不知道会不会扯着蛋。

万一再逼出一个谋反弑君桉，到时候山河动荡，又要血流成河。

翌日清晨，朝廷一连颁布三份诏书。

第一道，清查三杨谋反桉，涉桉官员达五万余人，主犯诛九族，次诛三族，再次斩首，最轻的是流放戍边。

统计下来，涉桉人员多达三十余万，这个数字让所有人触目惊心。

第二道诏书，朝廷机构改制，撤销内阁，增设海事总督府，还有翰林院、科学院等改动，每一条都写的清清楚楚，明明白白。

这条消息实在太过震撼，对于读书人而言，几乎是变了天。

不过，第三道诏书让他们更为震撼。

开恩科，而且，这一次恩科的方式和以前大不相同。

作为最重要的八股文已经成为一个普普通通的分类，其他的，诸如算学、工学、治水修路，更过分的是还有个武科，考兵法推演和骑马射箭。

诏书下发，全天下的读书人如丧考妣，欲哭无泪。

这三道诏书无疑是斩了读书人的根！

从此以后，天下的秩序将重新建立，士族们世代积累的人脉、财富、关系网……全都被抹杀殆尽，重新开始。

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江苏无锡，龟山书院。

大儒孙长河正在讲学，一名家丁打扮的人匆匆而至，拿着一个大信封。

“先生，京师来信！”

孙长河顿时脸色不悦，没看到我讲课呢，什么信非要现在看？

“放下吧！”

“是！”

家丁也不敢多言，放下信封，转身离去。

“……博学之，审问之，慎思之，明辨之，笃行之，此乃中庸之道，今日的课程就先讲到这里，听闻皇上欲开恩科，尔等需好生研读，争取榜上有名。”

学生们纷纷起身告辞，孙长河这才拿起信封，看到里面厚厚的几沓纸。

拿出来看了一眼，脸色开始变得古怪起来。

杀了这么多人，江南士族几乎被连根拔起，太狠了！

幸好自己近些年没怎么掺和这些烂事，而是潜心在此处教学，反而躲过一劫。

打开第二封……

“啊！”

孙长河直接蹦起来，浑身大汗淋漓，脸色甚是惊恐。

废掉内阁，阉割翰林院，这……

这是在挖大明江山的根啊！

“疯了，皇上疯了……”

孙长河口中喃喃私语，哆哆嗦嗦打开第三份……