谷/spanKCB的田端等人来温泉乡采访时，遭到沙伊哥美扎德控制的居民攻击，三人失散，田端在逃亡过程中遇见了先前躲藏起来的少年佐藤隆，了解到了手机催眠的事情。与此同时，XIG侦测到温泉乡发出的怪异电波，高山我梦驾驶EX战斗机赶来调查，发现了遇险的田端和佐藤隆。也在这时，沙伊哥美扎德现出真身并攻击我梦。高山我梦用微波装置照射的诱导波，破解了沙伊哥美扎德的波动生命体状态，并将其击落，但沙伊哥美扎德也在同时变化为战斗用的怪兽姿态。

高山我梦变身为盖亚·奥特曼登场，和沙伊哥美扎德作战。一开始，盖亚能有效地打击沙伊哥美扎德，但沙伊哥美扎德随后便以时空波光线回击盖亚，还利用催眠能力控制的温泉乡居民为人质，让盖亚无法攻击，沙伊哥美扎德更趁此时用电击重创盖亚，占据了上风。吉井玲子情急之下朝沙伊哥美扎德开枪，打断了怪兽对奥特曼的攻击，沙伊哥美扎德用光线攻击吉井玲子，但被藤宫博也变身的阿古茹·奥特曼抵挡。沙伊哥美扎德放开盖亚，转而攻击阿古茹，但反被阿古茹的投技重创，最后被阿古茹的必杀技光子粉碎机消灭。

超空间波动怪兽·沙伊哥美扎德二代，之前出现的沙伊哥美扎德的同类，外貌和沙伊哥美扎德十分相似，最大的特征与不同则在于腹部长有第二张脸。同样地，沙伊哥美扎德二代也是抱着人类的意识的兴趣而来，在通过虫洞来到地球的同时，沙伊哥美扎德二代在空中释放出大量的幻觉诱发粒子，干扰电子仪器的同时也攻击人类的记忆神经，制造出各种幻觉令人类深陷其中、无法自拔。

沙伊哥美扎德二代还特别针对防卫组织XIG的通讯员-佐佐木敦子而动作。沙伊哥美扎德二代干扰了佐佐木敦子的部分记忆，将敦子小时候丢失的人偶·莉莉娅部分的记忆巧妙地修改，捏造出童年好友莉莉娅这个存在，让敦子错认为莉莉娅是个真实存在的人。在敦子因为在和沙伊哥美扎德二代的战斗中操作失误一事而被暂时遣返地面休假时，沙伊哥美扎德二代又制造出莉莉娅的幻觉形象，任意地蛊惑并控制敦子。

高山我梦通过解析幻觉诱发粒子，查清了沙伊哥美扎德二代的能力，更追踪到了怪兽的大致位置。XIG和通信总部展开电波管制作战，切断电波而找出了沙伊哥美扎德二代的确切位置。在猎鹰队的炮火攻击下，沙伊哥美扎德二代现出怪兽化姿态，击落了猎鹰队的战斗机，随后又和高山我梦变身的盖亚·奥特曼展开战斗。

沙伊哥美扎德二代通过幻觉控制敦子时、吸收了敦子的精神能量加强自身，再凭借闪电光线等技能，一度令盖亚难以占据优势。

关键时刻，敦子在姐姐的帮助下回想起了真正的过去，被篡改的记忆恢复正常，幻觉莉莉娅同时被破除，导致精神能量的吸取中断、沙伊哥美扎德二代自身也受到影响而被虚弱。盖亚抓住时机展开反击，以连续踢击重创沙伊哥美扎德二代，随后施展必杀技「量子流线」击杀了怪兽，沙伊哥美扎德二代在烈火中被消灭。