据《水经注》记载，东汉以后，由于当时塔里木河中游的注滨河改道，导致楼兰严重缺水。

敦煌的索勒率兵1000人来到楼兰城，又召集鄯善、焉耆、龟兹三国兵士3000人，不分昼夜横断注滨河引水进入楼兰城缓解了楼兰缺水困境。

但在此之后，尽管楼兰人为疏浚河道作出了最大限度的努力和尝试，但楼兰城最终还是因断水而废弃了，民众南移，楼兰城最终成为今天的遗迹。

距今约1600年前楼兰古国消失，只留下处古城遗迹。地处罗布泊的西北角、孔雀河道南岸的7公里处。

……

史书又记，汉武帝初通西域，使者往来都经过楼兰。楼兰屡次替匈奴当耳目，并攻劫西汉使者。

元封三年（前108），汉派兵讨楼兰，俘获其王。楼兰即降汉，又遭匈奴的攻击，于是分遣侍子，向两面称臣。

匈奴侍子安归立为楼兰王，遂亲匈奴，成为了汉朝的心腹大患。曾在汉朝做质子的王弟尉屠耆亲汉。

昭帝元凤四年（前77），汉遣傅介子到楼兰，刺杀安归，立尉屠耆为王，改国名为鄯善，迁都扜泥城（今若羌附近）。

其后汉『政府』常遣吏卒在楼兰城故地屯田，自玉门关至楼兰，沿途设置烽燧亭障。魏晋及前凉时期，楼兰城成为西域长史治所。

公元400年，高僧法显西行取经，途经此地，他在《佛国记》中说，此地已是“上无飞鸟，下无走兽，遍及望目，唯以死人枯骨为标识耳”。

楼兰城--这座丝绸之路上的重镇在辉煌了近500年后，逐渐没有了人烟，在历史舞台上无声无息地消失了。

公元4世纪之后，北魏灭鄯善国，约600年鄯善国（楼兰国）至此灭亡。

千百年来，对于楼兰的消失，众说纷纭。