土豪们彼此虚情假意的结盟，暗中互相刺探情报，一旦抓住机会就予以对手无情的打击。这两块充满了残忍、狡诈的血腥山地逐渐演化成忍术发展的大本营。

伊贺、甲贺对忍者事业的最大贡献就是对忍术的理论基础和技能作出了系统化，编出了一本忍者的修炼宝典——《万川集海》。

虽然流派不同，忍者们修练的经典都是《万川集海》这本书，这本书的内容就是教导忍者如何施行忍术的一切理论基础与技能指导。在德川家族第四代将军德川家纲时代的延宝4年（1676年），

甲贺的隐士藤林保武结合天朝和岛国历代名将的思想与武学精华，参照《六韬》和《孙子兵法》的内容写成了集忍道、忍术、忍器于一体的忍者究极修行指南。并参照天朝古籍《文选?左思?吴都赋》中的“百川派别，归海而汇”思想，将书命名为《万川集海》。

正如书名所示《万川集海》就是海纳百川取各流派精髓的意思。《万川集海》由正心、将知、阴忍、阳忍、天时、忍器六部分组成。此书成为了后来忍者修行的必读教材。

《六韬》和《孙子兵法》是对《万川集海》及忍术整体发展影响较深的两部天朝古代着作，由此也可以看出，这些天朝古代的军事武学思想为以后岛国忍术的发展壮大奠定了充实的理论基础，这是忍术最早源于天朝的明证，可以说《万川集海》是岛国人学习天朝古代军事精华和密术玄学修炼之道后的概括总结。

忍者的修炼方法主要包括：

平衡训练，首先从走竹竿开始，至能立于滚圆竹竿上而不滑倒；将竹竿升离地面三尺左右，继续走竹竿，练到行动自如；继续增高竹竿高度，直至三四十尺高度民主，至此身不畏高，翻腾跳扎，如履平地。具备这样的平衡能力后，才能在屋顶、墙头及树木上行走如飞。

灵敏训练，训练从幼年开始，多进行灵敏素质专项训练，如跳过插满刀片的绳子，训练后期做危险障碍跑，跑步途中布满许多危险的障碍物，身法稍有不灵或反映略有不敏，即受障碍物致伤。因此，忍术的灵敏要求十分严格。

持久力训练，忍术的持久力训练分静、动两种练法。静练法：双手挂于树上，支持全身，地上则放满暗器，要求练者决不能松手跳下来，动练法，采用基本的长跑功夫，要有跑五六千里的耐力。

力量训练，忍术的力量训练力求最大限度的发挥人体的力量。

特殊技巧训练，忍术武技中的特殊技巧训练有多种：诸如潜水屏气、徒手搏斗、剑道、暗器、化装术、药物术、施毒解毒术、听力嗅觉训练等等，还要有高水平的忍饥耐渴的野外生存能力。

忍术武技要求忍者在剑术、箭术、马术、柔术、脚功、身体平衡、放毒镖等方面必须有一流的水平。但要求最高的武技还是闻名的隐身飞遁之术。这需要修炼内家真气的古武作支撑。所以真正的忍者，都是古武者。

除飞行隐身外，发放暗器亦为忍术武技之一绝。忍术暗器多为毒镖及铜币（边峰开刃），也有剑、钩、凿等。忍术暗器应用较多，掷发淬毒的铜币是每个忍术高手的绝活。

与“飞行术”“发暗器”并称“忍术三绝”的还有“施毒解毒术”。忍术高手个个都精于此道。