完成谈判以后，释放我爱罗等人，送回路上出现了根部忍者的拦截，还有木叶的暗部，四方乱斗。

根部的山中风阵亡，油女取根重伤，鸣人因为佐助重伤，佐助开启万花筒，自来也，卡卡西等人也是苦战。

和沙忍分开，紧急送鸣人回木叶，结果不料木叶内斗爆发，纲手权利被压制，自来也帮助纲手夺权。

日向家被牵扯在了木叶高层的斗争中，鸣人偷偷开启了任意门，转移日向一族。

鸣人带着佐助和雏田离开了木叶，小樱留在了纲手身边。

而这个时候浦原喜助研究出这个世界可以使用的义骸，不过材料稀缺，也只能让漩涡一族先行复活，随后治疗鸣人。

漩涡鸣人身体好以后带着佐助和雏田去往鬼之国降服了魍魉，鸣人接机吸收了魍魉的力量。

死神意志再一次苏醒，大量的死神被召唤出来，去往冥界，进行了对冥界的征讨，使得冥界一统。

完成这些的鸣人还没有喘口气，接到了大蛇丸的召唤，随去的还有佐助，大蛇丸研究鸣人的细胞出错，弄出了一个复制体的鸣人出来。

一翻激斗击杀了复制体，大蛇丸跟着鸣人去往雪之国。

木叶这边团藏把握住了木叶的政务，自来也纲手出逃。

团藏竟然真正的融合了柱间，随后纲手和自来也还有木叶的其他小强和上忍都逃到了雪之国。

团藏步步紧逼，随后木叶和雪之国发生了一场战争（这是升级后的世界，根部平均实力都已经是上忍。）

漩涡一族，死神，以及雾忍还有历代火影复活以后一场大战现在根部忍者全部覆灭，团藏外逃。

纲手以及自来也返回木叶，收拢残余人员。

历代火影没有离开，雷忍和土忍纷纷向着木叶宣战，沙忍蠢蠢欲动。

最后木叶加雪之国战胜雷土两国。

随后一年鸣人歇伏了起来，大力发展科技，连通木叶沙忍还有雪之国。

三方利益捆绑，我爱罗成功上任沙影，匠之国事情爆发，鸣人出发抢夺四把武器，三国威压匠之国。

又过两年，风忍遇到袭击，鸣人再次带队，争夺回了我爱罗，没有使得我爱罗被彻底抽取体内剩余的尾兽查克拉，不过还是损失可不少。